News Ticker

Swift Biosciences ประกาศเปิดตัว Indexed Adapters ชั้นนำของอุตสาหกรรมตัวใหม่ สำหรับการจัดเรียงลำดับตัวอย่างจำนวนมากด้วยการทำงานเพียงครั้งเดียว

Logo

การปฏิวัติเทคโนโลยีครั้งนี้จะช่วยเร่งการใช้การทำแผนที่ยีน การค้นพบดัชนีวัดทางชีวภาพ การสร้างโปรไฟล์ของเนื้องอก และการวิเคราะห์เชิงลึกของของเหลว

แอนน์ อาร์เบอร์, มิชิแกน –(BUSINESS WIRE)–3 สิงหาคม 2017

Swift Biosciences ผู้ให้บริการชั้นนำด้านโซลูชั่นการจัดเตรียมห้องสมุดสำหรับการจัดลำดับจีโนมได้ประกาศ เปิดตัว Accel-NGS® 2SIndexed Adapters ในวันนี้ ซึ่งเป็น Indexed Adapters ตัวใหม่ที่ช่วยปรับปรุงการจัดเรียงลำดับแห่งโลกอนาคตได้อย่างมีนัยสำคัญ โดยแพลตฟอร์มIllumina® ชุดดัชนีที่มีเอกลักษณ์ชุดนี้ ถือเป็นชุดที่ใหญ่ที่สุดที่มีวางขายในเชิงพาณิชย์ สำหรับการใช้งานจัดลำดับจีโนมที่มีจำนวนมาก ทำให้ผู้ใช้สามารถสร้างมัลติเพล็กซ์ดัชนีเดี่ยว (single-indexed samples)ได้ถึง 96 ตัวอย่าง และ 768 ตัวอย่างสำหรับการจัดทำดัชนีแบบคู่ขนานต่อหนึ่งการทำงาน (dual-indexed samples per run) ซึ่ง เทคโนโลยีชั้นนำในอุตสาหกรรมตัวนี้สามารถตอบสนองความต้องการที่เพิ่มขึ้นจากห้องปฏิบัติการและวิจัย เพื่อรวบรวมตัวอย่างตัวอย่างจำนวนมากขึ้น ต่อการใช้เครื่องมือน้อยลง ทำให้สามารถจัดลำดับที่ประหยัดมากขึ้นและให้ความถูกต้องของข้อมูลที่ดีขึ้น

การเรียงลำดับดีเอ็นเอแบบมัลติเพล็กซ์เป็นกระบวนการทำงานยอดนิยม ซึ่งจะมีการรวมตัวอย่างที่ติดฉลากหลายตัวเข้าเป็นชุดเดียวกัน เพื่อการปฏิบัติการณ์ครั้งเดียว เพื่อเพิ่มปริมาณการผลิตและลดต้นทุนการจัดลำดับ จากงานวิจัยล่าสุดพบว่าตัวจัดลำดับดัชนีที่มีจำหน่ายในท้องตลาดอื่น ๆ จะได้รับผลกระทบจากข้อผิดพลาดของทำมัลติเพล็กซ์ซ้ำ ๆ ซึ่งเรียกว่า "index hopping" ซึ่งก็คือการอ่านลำดับที่ไม่ถูกต้องกับตัวอย่าง นอกจากนี้เทคโนโลยีการจัดลำดับดีเอ็นเอมัลติเพล็กซ์แบบเก่ายังมีแนวโน้มที่จะเกิดข้อผิดพลาดในการเรียงลำดับอื่น ๆ ซึ่งไปเพิ่มอัตราความผิดพลาดของการจัดอันดับการอ่านที่ไม่ถูกต้อง และเมื่อแพลตฟอร์มการจัดอันดับมีการเพิ่มกำลังการผลิตมากขึ้น เช่นแพลตฟอร์มใหม่ล่าสุดของ Illumina, NovaSeq ™ ดังนั้นจึงจำเป็นต้องใช้ดัชนีที่มีประสิทธิภาพสูง เพื่อให้สามารถจัดกลุ่มตัวอย่างเป็นจำนวนมากสำหรับความต้องการขนาดใหญ่ได้

นักวิจัยจาก Swift Biosciences กล่าวว่า Accel-NGS 2S Adapters Indexed เป็นชุดของดัชนีเดี่ยว 96 ชุดที่เหมาะสำหรับการทำงานร่วมกับ Illumina TruSeq® P5 adapters เพื่อให้มีชุดค่าผสมแบบ dual-index ได้ถึง 768 ชุด โดยตัวดัชนีใหม่เหล่านี้ได้รับการปรับปรุงเพื่อให้มีความยืดหยุ่นมากขึ้นในการประมวลผลชุดตัวอย่างได้ระหว่าง 96-768 ตัวอย่าง ที่มีการทำงานไม่ซ้ำกัน และสามารถรองรับช่วงกว้างของโครงการที่มีการจัดลำดับความลึกที่แตกต่างกันออกไป นอกจากนี้การออกแบบที่เป็นเอกลักษณ์ยังช่วยลดการอ่านไม่ถูกต้องและ Index Hoppingซึ่งเป็นปัญหาเฉพาะสำหรับรูปแบบรูปแบบการไหลของเซลล์ของ Illumina ซึ่งการพัฒนาให้ดีขึ้นนี้จะทำให้มีความไวมากขึ้นในการตรวจจับตัวแปรความถี่ต่ำ และทำให้เกิดความสม่ำเสมอคงที่มากขึ้นเพื่อเร่งการ de-multiplexing ในระหว่างการวิเคราะห์ข้อมูล

 “เป้าหมายของเราที่ Swift คือการช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถสร้างข้อมูลที่มีคุณภาพสูงสุดจากประเภทตัวอย่างใด ๆ ทำให้พวกเขาสามารถผลักดันขอบเขตของวิทยาศาสตร์ของพวกเขาได้อีก " Timothy Harkins ประธานและซีอีโอของ Swift Biosciences กล่าว "Accel-NGS 2S Indexed Adapters รุ่นใหม่ของเราจะปิดการรั่วไหลและช่องว่างช่องทางบนแพลตฟอร์ม Illumina และเมื่อรวมกับเทคโนโลยี Accel-NGS 2S ทุกการปฏิบัติการเรียงลำดับจะสร้างข้อมูลที่มีคุณภาพสูงขึ้น แต่ประหยัดค่าใช้จ่ายมากขึ้น"

คำสั่งซื้อเชิงพาณิชย์ครั้งแรก

อะแดปเตอร์ที่ทำดัชนีแล้วของ Accel-NGS 2S มีวางจำหน่ายแล้วในท้องตลาด คำสั่งซื้อในเชิงพาณิชย์ครั้งแรกจะถูกจัดส่งให้กับบริษัท Shanghai  Nanodigmbio Biotechnology Co. LTD ซึ่งเป็นหุ้นส่วนที่เป็นช่องทางการจำหน่าย ผลิตภัณฑ์ของ Swift ในประเทศจีน โดย Shanghai Nanodigmbio Biotechnology เป็นหนึ่งในช่องทางการตลาดสำหรับผลิตภัณฑ์การหาลำดับที่เติบโตเร็วที่สุดและมีบทบาทสำคัญในการวิจัยเกี่ยวกับพันธุกรรมและโรค โดยในปี 2016 จีนได้เปิดตัว "แผนห้าปี" ที่มุ่งเน้นยุทธศาสตร์ด้านยาที่มีความแม่นยำสูง และการเป็นศูนย์กลางการศึกษาการเติบโตอย่างรวดเร็วในด้านจีโนม ซึ่งจะเป็นแนวทางในการพัฒนาด้านการวินิจฉัยและการรักษาในอนาคต

Chance Wu, CEO ซีอีโอ ของ Shanghai Nanodigmbio Biotechnology Company กล่าวว่า "อะแด็ปเตอร์ที่ได้รับการจัดทำดัชนีใหม่ของ Swift เป็นข้อได้เปรียบที่สำคัญสำหรับนักวิจัยที่กำลังดำเนินการหาลำดับ ตอนนี้นักวิจัยสามารถที่จะเพิ่มจำนวนของเอ็กโซมต่อการทำงาน เพื่อการสำรวจชุดตัวอย่างขนาดใหญ่ได้อย่างรวดเร็ว และในรูปแบบที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น "

ดูเวอร์ชันต้นฉบับได้ที่ businesswire.comhttp://www.businesswire.com/news/home/20170803006256/en/

ติดต่อ:

Lambert, Edwards & Associates
Darby Wagner, (616) 258-5779
dwagner@lambert-edwards.com

Be the first to comment

Leave a Reply